Index A | C | G | H | I | M | R | S A app.modules.all_descriptors module app.modules.classyfire module app.modules.coconut.descriptors module app.modules.coconut.preprocess module app.modules.decimer module app.modules.depiction module app.modules.npscorer module app.modules.toolkits.cdk_wrapper module app.modules.toolkits.openbabel_wrapper module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper module app.modules.tools.sugar_removal module app.modules.tools.surge module C check_RO5_violations() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) classify() (in module app.modules.classyfire) convert_image() (in module app.modules.decimer) G generate_structures_SURGE() (in module app.modules.tools.surge) get_2d_mol() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_3d_conformers() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_all_cdk_descriptors() (in module app.modules.all_descriptors) get_all_rdkit_descriptors() (in module app.modules.all_descriptors) get_aromatic_ring_count() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_canonical_SMILES() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_cdk_depiction() (in module app.modules.depiction) get_CDK_descriptors() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_CDK_HOSE_codes() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_CDK_IAtomContainer() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_cdk_rdkit_combined_descriptors() (in module app.modules.all_descriptors) get_CDK_SDG() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_CDK_SDG_mol() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_cip_annotation() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_COCONUT_descriptors() (in module app.modules.coconut.descriptors) get_COCONUT_preprocessing() (in module app.modules.coconut.preprocess) get_CXSMILES() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_descriptors() (in module app.modules.coconut.descriptors) get_ertl_functional_groups() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_GhoseFilter() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_heavy_atom_count() (in module app.modules.tools.surge) get_InChI() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_mol_block() (in module app.modules.coconut.preprocess) get_molecule_hash() (in module app.modules.coconut.preprocess) get_murko_framework() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_np_model() (in module app.modules.npscorer) get_np_score() (in module app.modules.npscorer) get_ob_canonical_SMILES() (in module app.modules.toolkits.openbabel_wrapper) get_ob_InChI() (in module app.modules.toolkits.openbabel_wrapper) get_ob_mol() (in module app.modules.toolkits.openbabel_wrapper) get_PAINS() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_predicted_segments() (in module app.modules.decimer) get_predicted_segments_from_file() (in module app.modules.decimer) get_properties() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_rdkit_CXSMILES() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_rdkit_depiction() (in module app.modules.depiction) get_rdkit_descriptors() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_rdkit_HOSE_codes() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_REOSFilter() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_representations() (in module app.modules.coconut.preprocess) get_RuleofThree() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_sas_score() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_segments() (in module app.modules.decimer) get_smiles_opsin() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_sugar_info() (in module app.modules.tools.sugar_removal) get_table() (in module app.modules.all_descriptors) get_tanimoto_similarity() (in module app.modules.all_descriptors) get_tanimoto_similarity_CDK() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_tanimoto_similarity_ECFP_CDK() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_tanimoto_similarity_PubChem_CDK() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_tanimoto_similarity_rdkit() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) get_vander_waals_volume() (in module app.modules.toolkits.cdk_wrapper) get_VeberFilter() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) H has_stereochemistry() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) I is_valid_molecule() (in module app.modules.toolkits.rdkit_wrapper) M module app.modules.all_descriptors app.modules.classyfire app.modules.coconut.descriptors app.modules.coconut.preprocess app.modules.decimer app.modules.depiction app.modules.npscorer app.modules.toolkits.cdk_wrapper app.modules.toolkits.openbabel_wrapper app.modules.toolkits.rdkit_wrapper app.modules.tools.sugar_removal app.modules.tools.surge R remove_circular_sugar() (in module app.modules.tools.sugar_removal) remove_linear_and_circular_sugar() (in module app.modules.tools.sugar_removal) remove_linear_sugar() (in module app.modules.tools.sugar_removal) result() (in module app.modules.classyfire) S score_mol() (in module app.modules.npscorer) score_mol_with_confidence() (in module app.modules.npscorer)