Cheminformatics Microservice

• Python Submodules
  • app.modules.npscorer module
    • get_np_model()
    • get_np_score()
    • score_mol()
    • score_mol_with_confidence()
  • app.modules.depiction module
  • app.modules.decimer module
    • convert_image()
    • get_predicted_segments()
    • get_predicted_segments_from_file()
    • get_segments()
  • app.modules.classyfire module
    • classify()
    • result()
  • app.modules.alldescriptors module
• Tools
  • app.modules.tools.surge module
    • generate_structures_SURGE()
    • get_heavy_atom_count()
  • app.modules.tools.sugar_removal module
• Toolkits
  • app.modules.toolkits.rdkit_wrapper module
    • check_RO5_violations()
    • get_2d_mol()
    • get_3d_conformers()
    • get_properties()
    • get_rdkit_CXSMILES()
    • get_rdkit_HOSE_codes()
    • get_rdkit_descriptors()
    • get_tanimoto_similarity_rdkit()
    • has_stereochemistry()
    • is_valid_molecule()
  • app.modules.toolkits.cdk_wrapper module
  • app.modules.toolkits.openbabel_wrapper module
    • get_ob_InChI()
    • get_ob_canonical_SMILES()
    • get_ob_mol()
• COCONUT Modules
  • app.modules.coconut.preprocess module
  • app.modules.coconut.descriptors module